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| Date | Player | From | To | Type |
|---|---|---|---|---|
| 01.07.2015 | M. Brašnić | Bayer Leverkusen | SC Paderborn 07 | Loan |
| 01.07.2015 | P. Richter | Bayer Leverkusen | — | Free |
| 01.07.2015 | A. Milik | Bayer Leverkusen | Ajax | € 2.8M |
| 01.07.2015 | D. Kohr | Bayer Leverkusen | FC Augsburg | € 2M |
| 01.07.2015 | N. Lomb | Bayer Leverkusen | — | Loan |
| 07.01.2015 | Philipp Wollscheid | Bayer Leverkusen | — | Loan |
| 01.01.2015 | L. Öztunalı | Bayer Leverkusen | Werder Bremen | Loan |
| 01.01.2015 | N. Lomb | Bayer Leverkusen | — | Loan |
| 01.09.2014 | Philipp Wollscheid | Bayer Leverkusen | FSV Mainz 05 | Loan |
| 27.08.2014 | M. Cacutalua | Bayer Leverkusen | VfL Bochum | Loan |
| 15.08.2014 | Ryu Seung-Woo | Bayer Leverkusen | — | Loan |
| 09.07.2014 | K. Stafylidis | Bayer Leverkusen | Fulham | Loan |
| 03.07.2014 | E. Can | Bayer Leverkusen | Liverpool | € 12M |
| 02.07.2014 | E. Zenga | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 02.07.2014 | D. da Costa | Bayer Leverkusen | — | Free |
| 01.07.2014 | A. Guardado | Bayer Leverkusen | Valencia | N/A |
| 01.07.2014 | K. Narey | Bayer Leverkusen | Borussia Dortmund | Free |
| 01.07.2014 | N. Perrey | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 01.07.2014 | L. Hombach | Bayer Leverkusen | Fortuna Düsseldorf | Free |
| 01.07.2014 | S. Sam | Bayer Leverkusen | FC Schalke 04 | € 2.5M |
| 01.07.2014 | J. Hegeler | Bayer Leverkusen | Hertha BSC | 900K € |
| 01.07.2014 | M. Hartwig | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 01.07.2014 | T. Feilhaber | Bayer Leverkusen | — | Free |
| 01.07.2014 | M. Wagener | Bayer Leverkusen | — | Loan |
| 01.07.2014 | L. Heine | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 01.07.2014 | D. Engelman | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 01.07.2014 | O. Schnitzler | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 01.07.2014 | R. Leuchter | Bayer Leverkusen | — | Free |
| 01.07.2014 | P. Chato | Bayer Leverkusen | — | Loan |
| 01.07.2014 | A. Bouhaddouz | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 01.07.2014 | M. Cacutalua | Bayer Leverkusen | — | Loan |
| 01.07.2014 | D. Jamann | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 01.07.2014 | S. Hirsch | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 01.07.2014 | L. Dürholtz | Bayer Leverkusen | — | Free |
| 01.07.2014 | J. Pohjanpalo | Bayer Leverkusen | Fortuna Düsseldorf | Loan |
| 01.07.2014 | A. Mühling | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 01.07.2014 | A. Milik | Bayer Leverkusen | Ajax | Loan |
| 01.07.2014 | L. Paqarada | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 01.07.2014 | J. Meffert | Bayer Leverkusen | — | Free |
| 01.02.2014 | C. Siefkes | Bayer Leverkusen | — | Free |
| 01.02.2014 | S. Wurm | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 29.01.2014 | Wilfried Sarr | Bayer Leverkusen | Borussia Mönchengladbach | Free |
| 13.01.2014 | D. Kohr | Bayer Leverkusen | FC Augsburg | Loan |
| 04.01.2014 | A. Mandt | Bayer Leverkusen | — | N/A |
| 20.11.2013 | M. Friedrich | Bayer Leverkusen | Borussia Dortmund | Free |
| 06.09.2013 | S. Bakış | Bayer Leverkusen | Kayserispor | € 150K |
| 03.09.2013 | J. Pohjanpalo | Bayer Leverkusen | — | Loan |
| 30.08.2013 | A. Milik | Bayer Leverkusen | FC Augsburg | Loan |
| 26.08.2013 | E. Zenga | Bayer Leverkusen | — | Loan |
| 22.08.2013 | K. Bellarabi | Bayer Leverkusen | — | Loan |